水稻种子休眠不同生育阶段的加性效应分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

水稻是世界上重要的粮食作物之一。株高、生育期、产量和品质等数量性状都属于水稻重要农艺性状（何风华等，2004），其基因定位克隆在理论和实践上具有重要的意义。水稻生育期作为重要的农艺性状之一。随着水稻种植区域的不断跨大，不同种植地区对优良品种生育期的长短提出了要求，合理的调整生育期可以扩大优良品种的推广区域，保证水稻的产量。通过遗传育种方法改变品种的生育期,特别是缩短生育期,对水稻生产的发展具有重要意义（邓晓建等，2001）。

生育期是指从营养生长阶段转变到生殖生长所需的时间，通常生育期长短可用从播种到抽穗的天数来反映（何风华等，2004；shokokojimaet,2002；masahiroyanoet,2000）。目前，生育期相关基因定位和克隆国内外已经有很多报道。据相关统计，生育期相关qtls位点已有734个被报道，其中水稻占618个，是被报道最多的作物；另外，水稻生育期相关基因已有8个基因（ghd8、osfca、hd-1、hd3a、hd-3、hd6、ehd2和ehd1）克隆。ghd8是个一因多效基因，同时控制株高和产量，被定位8号染色上（wen-haoyanet.2011）。osfca被定位在9号染色体上，其的产物包含有rna结合结构域、ww结构域和atswi3b结构域，主要是参与光周期通路（jeong-hwanleeet，2005）。hd-1、hd3a和hd-3都是光周期敏感基因，都定在6号染色体上，hd-1是个早熟基因，hd-3是迟熟基因，hd3a和hd-3是微效基因（m.yanoet，1997；t.yamamotoet，1998；masahiroyanoet，2000；l.monnaet，2002；shokokojimaet，2002；hironoriitohet，2010）。ehd2和ehd1都是早抽穗基因，都定位在10号染色体（kazukimatsubaraet，2008；kazuyukidoiet，2004）。

随着水稻全基因组的发展，水稻种子活力相关基因相继得到研究，其中多个qtl位点基因被报道。但是，目前水稻种子活力相关基因位点仍然有很多未知，继续探索其相关qtl位点，挖掘新水稻种子活力相关基因，依然具有重要意义。本研究利用地方粳稻品种大关稻和国际稻ir28，通过单籽粒传法构建了重组自交系，并对每个株系进行种子活力鉴定，发掘水稻种子活力相关的qtl位点，以便今后的水稻种子活力相关基因克隆和功能奠定基础。

2. 研究的基本内容和问题

伴随分子标记辅助选择的兴起和数量遗传学的发展，株高、生育期、产量和品质等数量性状qtl定位和克隆技术日渐成熟，并且多个基因已经成功克隆。为了继续探索和发掘水稻生育期相关的新基因，本研究选择了抽穗晚期粳稻品种韭菜青和早期抽穗籼稻品种ir26作为实验材料。同时，利用单粒传法构建了重组自交系，进而构建水稻全基因组遗传图谱。

生育期是指从营养生长阶段转变到生殖生长所需的时间，通常生育期长短可用从播种到抽穗的天数来反映。为此，本研究统计两亲本和每个重组自交系从播种到抽穗所需要的天数，其中家系以80%抽穗时作为抽穗。根据遗传图谱和生育期表型统计结果，利用生物学和遗传学统计软件，可以发现水稻生育期相关的新qtl位点。

本研究利用韭菜青和ir26构建的重组自交系（rils）对水稻生育期相关基因位点进行定位，分析水稻生育期相关基因的遗传机制，力求发掘新的水稻生育期相关基因。本研究可以发掘水稻生育期相关的新基因，也可以后水稻生育期相关基因的克隆和功能分析提高基础；同时，可为水稻生育期结构进行遗传改良提供理论依据，实现理论与实际相结合。

3. 研究的方法与方案

提取dna，扩增ssr标记。

统计两亲本和每个家系从播种至抽穗所需天数。

构建遗传图谱。

4. 研究创新点

本研究利用的早抽穗品种韭菜青和和晚抽穗品种IR26，其中韭菜青是地方品种，具有地方特色。利用重组自交系（RILs）对水稻生育期相关基因位点进行初定位，可分析水稻生育期相关基因的遗传机制，并能发掘新的水稻生育期相关基因。同时，为以后水稻生育期相关基因的克隆和功能分析奠定基础，也为水稻生育期结构进行遗传改良提供理论依据，以实现理论与实际相结合。

5. 研究计划与进展

（1）查阅文献，确定实验课题，并进行实验。

（2）对实验数据进行筛选。

（3）处理数据，完成毕业论文。