水稻种子休眠性的全基因组关联分析开题报告

 2023-02-18 10:02

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

课题意义

水稻(oryza satival.)是世界上最重要的粮食作物之一,全球一半以上人口以水稻为主食。在稻米生产中,若籽粒灌浆期连续高温阴雨,或成熟的水稻因连续阴雨未能及时收获,易出现穗上发芽(pre-harvest spouting,phs)。水稻穗发芽是影响水稻产量、稻米品质、稻谷贮藏和种用价值的重要生理性状。在中国南方稻区,有 1/3 的年份会在成熟期遇到高温阴雨天气而发生穗发芽[1]。杂交制育种过程中使用外源赤霉素也是引起田间稻穗萌发的主要因素之一。

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2. 研究的基本内容和问题

目标:利用gwas挖掘水稻休眠相关基因位点。

内容:

(1)水稻种子休眠性状考察

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3. 研究的方法与方案

研究方法:本课题以种植在南京农业大学的676份水稻资源为试验材料,进行全基因组关联分析,对种子休眠性进行全基因组的qtl检测。

技术路线:

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4. 研究创新点

利用全基因组关联分析,可以同时得到多个水稻休眠性相关QTL位点,针对这些位点,可根据基因组序列信息在其附近开发更多的标记(SSR、INDEL、SNP 等)进行加密,对目标性状QTL进行精细定位,从而开发出可用于辅助育种的分子标记,甚至发掘到未报道过的水稻休眠相关基因。

5. 研究计划与进展

研究计划:

2018年 7月下旬至2018年10月下旬

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