水稻剑叶大小相关性状的全基因组关联分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

研究意义：

水稻是最为重要的粮食作物之一，水稻产量关乎全球近一半人口的粮食问题。叶和穗是水稻形态上的两个关键器官。叶作为水稻最主要的光合器官，为植物的生长、生产提供了绝大部分能量，与穗部籽粒的产量息息相关。据报道，除剑叶宽外, 水稻上三叶的叶长、叶宽都与单株产量呈极显著正相关[1]。叶片形态作为水稻“理想株型”的重要组成部分, 逐渐成为了水稻高产育种的热点问题。袁隆平于1997年提出了水稻超高产理想株型模式。理想株型需要具备上三叶“长，直，窄，凹，厚”，修长而直挺的叶片 ,不仅叶面积较大 ,而且可两面受光和互不遮蔽 ;窄而略凹的叶片 ,所占的空间面积小但整叶的面积并不因窄而减小;较厚的叶片光合效率高且不易早衰[1]。对于植株个体而言，理想的叶形有助于形成协调的库源关系，避免过强的蒸腾与辐射；对于群体而言，有利于协调群体密度，提高光合效率。因此水稻叶的发育与调控的遗传与调控机制研究可为改善光能利用率和提高水稻产量提供理论基础，对于育种来说有着重要意义。

研究进展：

2. 研究的基本内容和问题

研究目标：

利用gwas挖掘水稻叶形相关基因位点。

研究内容：

3. 研究的方法与方案

研究方法：

本课题对种植在南京农业大学土桥水稻试验基地的水稻种质资源库的439份种质资源进行剑叶相关性状调查，并进行全基因组关联分析，对种子全基因组的qtl检测。

技术路线：

4. 研究创新点

利用全基因组关联分析，可以同时得到多个水稻剑叶长宽性状相关QTL位点，针对这些位点，可根据基因组序列信息在其附近开发更多的标记(SSR、INDEL、SNP 等)进行加密，对目标性状QTL进行精细定位，从而开发出可用于辅助育种的分子标记，甚至发掘到未报道过的水稻叶形相关基因。

5. 研究计划与进展

研究计划:

2018年 7月下旬至2018年10月下旬

1.查阅相关资料，准备相关实验材料。