6种鲤鱼线粒体DNA D-loop区的遗传差异分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

研究意义:

物种或群体的遗传多样性大小是长期进化的产物，是其生存和进化的前提。一个群体的遗传变异越高或遗传多样性越丰富，对环境变化的适应能力就越强，越易扩散其分布范围和开拓新的环境。通过对不同群体遗传多样性的研究，并结合地质变迁的资料，不仅可阐述种群间的亲缘关系，还可以推测他们的起源、分化和扩散途径。一个物种的进化潜力和抵御不良环境的能力既取决于群体遗传变异的大小，也依赖于群体的遗传结构。群体的遗传变异大小与其进化速度成正比。因而，对群体的遗传多样性研究可揭示群体的进化历史。同时，对不同群体间的遗传多样性比较研究可探讨群体间的遗传分化与系统进化关系^[1]。

鱼类mtdna非编码区的结构与动物的相似，都有3个区域，即终止序列区、中央保守区和保守序列区，终止序列区位于非编码区的5`端，包含与dna复制终止相关的序列tas，拷贝数在1-8之间，是mtdna长度变异的主要原因^[2]。在mtdna上，d-loop区的进化速度最快，用它来进行种内、种群间的系统进化分析，是一种在分子水平上研究鱼类种群遗传多样性比较经济有效的手段^[3]。

2. 研究的基本内容和问题

（一）研究内容

对6种不同鲤鱼的线粒体dna　d-loop区进行克隆和序列测定，并对6种鲤鱼群体内和群体间的线粒体dna　d-loop区的序列多态性进行分析。

（二）研究目标

3. 研究的方法与方案

（一）研究方法

1.选取6种不同鲤鱼，每种鲤鱼取6-8尾。

2.从实验鱼采血或组织，提取基因组dna。

4. 研究创新点

通过查阅文献可知目前国内对鲤鱼线粒体D-loop区相关的研究已有一些报道，但对多种鲤鱼的鱼线粒体D-loop区序列进行比较分析还较少，本实验将对6种鲤鱼线粒体D-loop区进行分离、测序并进行序列多样性分析。

5. 研究计划与进展

（1）2014年9月12月：实验试剂的购买及配置、熟悉实验仪器及实验操作、开展预备实验；

（2）2015年1月4月：选取6种鲤鱼若干，提取基因组dna，进行d-loop区pcr扩增与序列测定；

（3）2015年5月6月：整理、统计以及分析实验数据，并撰写研究论文。