3株猪繁殖与呼吸综合征病毒的全基因序列测定与分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

本课题的意义、国内外研究概况、应用前景等（列出主要参考文献）一、意义猪繁殖与呼吸综合征（porcine reproductive and respiratory syndrome, prrs）是危害养猪业最具有经济重要性的疾病之一，该病的临床特征是母猪的繁殖障碍和新生仔猪的呼吸道症状。

该病于1987年首次在美国发生,1991年分离到病原。

十几年来prrs给全球养猪业带来了巨大的经济损失,成为困扰当今世界养猪业健康发展的主要问题之一。

2. 研究的基本内容和问题

研究的目标、内容和拟解决的关键问题一、研究目标 、内容将实验室分离到的prrsv zj 毒株用rt-rcr进行全基因组序列测定，对分段完成测序的基因序列进行拼接，获得prrsv zj 毒株的全基因组序列。

利用 dnastar 软件对 prrsv zj 毒株的基因组序列和推导的氨基酸序列进行分析，同时将该基因序列和推导的氨基酸序列与美洲型毒株和国内分离株进行比较,确定该分离株的来源和遗传变异，为疫苗的选用提供参考。

同时为研究 prrsv 的基因遗传和变异提供理论依据，也为设计prrsv的分子诊断方法及研制基因工程疫苗提供参考数据。

3. 研究的方法与方案

研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析一、研究方法1.pt-pcr1.1将所得病料提取rna,并将所得rna反转录为cdna。

2.1按照诺唯赞phanta super-fidelity dna polymerase说明书，将cdna、设计的12条引物、dna polymerase、dntp建立20μl体系进行dna扩增。

2.3．pcr产物进行琼脂糖凝胶电泳。

4. 研究创新点

特色或创新之处本研究从感染PRRSV发病的临床病料中分离到病毒，明确该毒株的基因组特征有助于进一步其毒株生物学特性、遗传变异和致病性，对防控PRRS在我国暴发和流行具有重要的理论指导意义。

5. 研究计划与进展

研究工作的总体安排及进度1.2017年09月～2017年10月：学习实验室基本规章制度，学习常规的仪器的使用，常规的试验操作方法。

2.2017年11月～2017年12月：收集实验材料，查阅文献，为试验做准备；学习本实验室的全长构建方法；3.2018年02月～2018年04月：独立进行试验，并及时交流和反馈给老师。

4.2018年05月-2018年06月：整理试验数据，撰写论文，论文答辩。